Raudtee- ja energiateenistuse põhiülesanded on:
- raudteeinfrastruktuuri läbilaskevõime jaotamise kohta esitatud kaebuste menetlemine;
- turgu valitsevat seisundit omavate ettevõtjate või seaduses ettenähtud kütuse- ja energiaettevõtjate majandustulemuste kontrollimine ning nende poolt müüdava kütuse- ja energiahindade kooskõlastamine ja kontrollimine;
- liitumistasude kontrollimine ja liitumistasu metoodikate kooskõlastamine ning liitumislepingute tingimuste kontrollimine ja kooskõlastamine;
- turgu valitsevat seisundit omavate energia-, võrgu- või kütuseettevõtjale tegevus- ja arenduskohustuse panemine ja selle täitmise kontrollimine;
- võrguettevõtja edastamis- ja jaotamisteenuse tariifide kooskõlastamine ja kontrollimine;
- kütuse- ja energiaettevõtjatele tegevuslubade väljastamine ning järelevalve teostamine tegevusloa tingimuste järgimise üle;
- raudtee-ettevõtjatele tegevuslubade andmine või andmisest keeldumine, tegevuslubade kehtivuse peatamine või lõpetamine või tegevuslubade kehtetuks tunnistamine.